目前医学上还不能确切知晓唇腭裂的发生根源，通常有以下两大原因：
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(一)环境因素：母亲怀孕早期(怀孕3个月以前)出现下述某种状况可能会导致宝宝唇腭裂： 爱美.伊.人网
1.病毒感染：如孕妇上呼吸道感染、风疹等; 爱美伊人网
2.药物作用：如服用抗癫痫药、类胆固醇、抗过敏、抗癌药物等;
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3.内分泌：精神性或损伤性因素，如遭到强烈的精神刺激、身体外部遭损伤等;
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4.营养因素：早孕期呕吐，厌食，偏食等导致维生素D、叶酸、铁、钙等缺乏;
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5.其他因素：如照射X线，吸烟，酗酒，缺氧。 爱美伊人网
(二)遗传因素：唇腭裂有相当部分是遗传的，直系亲属有唇裂者，其后代发生该病的比率为4%左右。一般唇腭裂发生在第一胎的概率为1/600，如果第一胎是唇腭裂的在第二胎发生唇腭裂的几率为3/100。
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唇腭裂对儿童的影响影响是多方面的：
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1.严重影响面部美观; 本文来自www.a·m·w·a·p.com
2.影响吸奶和吞咽;
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3.妨碍发音;
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4.由于口鼻相连，因此，经常招致上呼吸道感染，并发中耳炎等疾病;
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5.对儿童心理造成不良影响，患儿易产生自卑等负面心理。
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